Предлагаю внести пару мелких правок в: \modules\configuration\views\custom_html.php
Код: Выделить всё
$('.CodeMirror').css('top', cm.getOption("fullScreen") ? $('.header.navbar').css('height') : 'auto' );
Код: Выделить всё
if (cm.getOption("fullScreen")) { cm.setOption("fullScreen", false) , $('.CodeMirror').css('top','auto') };
и он перестанет прятаться за navbar: